行政事业单位在资产管理中面临以下管理挑战：

1、国家以法律形式明确了行政事业单位国有资产管理体制和各部门（单位）管理职责，全面规范了资产配置、使用、处置等各环节的管理，构建了从资产配置、使用到处置全过程的有效监管体系。

2、政府机构事物繁杂，导致人员工作负荷高，人力投入成本大增。

3、每年政府管理工作中，投入的各类资产数量庞大，带来的管理难度越来越大，截至2018年末，全国行政事业性国有资产总额33.5万亿元。其中，行政单位资产10.1万亿元，事业单位资产23.4万亿元。

4、政府管理过程中，对于所有投入要求符合节能环保要求。